20 (s) -kamptotecino analogų 3D-qsar tyrimas | acta pharmaologica sinica

20 (s) -kamptotecino analogų 3D-qsar tyrimas | acta pharmaologica sinica

Anonim

Anotacija

Tikslas:

Sukurti 20 ( S ) -kamptotecino (CPT) analogų kiekybinį struktūros ir aktyvumo santykio (QSAR) modelį naujų CPT analogų aktyvumui numatyti kuriant vaistus.

Metodai:

Treniruotės rinkinys, sudarytas iš 43 struktūriškai skirtingų CPT analogų, kurie buvo topoizomerazės I inhibitoriai, buvo panaudoti kiekybiniam struktūros ir aktyvumo santykio modeliui sudaryti su lyginamąja molekulinio lauko analize (CoMFA). QSAR modelis buvo optimizuotas naudojant dalinių mažiausių kvadratų (PLS) analizę. Bandymo rinkinys, sudarytas iš 10 junginių, buvo įvertintas naudojant modelį.

Rezultatai:

CoMFA modelis buvo sudarytas sėkmingai, ir buvo gauta gera kryžmiškai patvirtinta koreliacija, kurioje q 2 buvo 0, 495. Tada buvo atlikta kryžminiu būdu nepatvirtinto PLS modelio, kuriame r 2 buvo 0, 935, analizė ir leido įrodyti aukštą 10 CPT analogų veiklos nuspėjamumą atsitiktinai parinktame bandymų rinkinyje.

Išvada:

CoMFA modelis parodė, kad nepatogi neigiamai įkrauta grupė CPT 9, 10 ir 11 padėtyse padidins aktyvumą, tačiau pernelyg padidinanti nepatogią grupę 10-oje padėtyje neigiamai veikia slopinamąjį aktyvumą; pakaitalai, užimantys 7 vietą su nepatogiąja teigiama grupe, sustiprins slopinamąjį aktyvumą. Modelis gali būti naudojamas kuriant naujus CPT analogus ir suprantant veikimo mechanizmą.