Cheminė biologija (Vasaris 2020)

Allosterinis hipoksijos sukelto faktoriaus 2 slopinimas mažomis molekulėmis

Allosterinis hipoksijos sukelto faktoriaus 2 slopinimas mažomis molekulėmis

Dalykai Biochemija Biofizika Vėžys Cheminiai įrankiai Didelio našumo atranka Mažos molekulės Anotacija Hipoksijos sukeliami veiksniai (HIF) yra heterodimeriniai transkripcijos veiksniai, sukeliami daugelio vėžio formų atvejais, kai jie dažnai skatina protumorigeninių kelių raišką. Nors transkripcijos veiksniai paprastai laikomi „nepageidaujamais“, HIF-2α subvieneto PAS-B domenas savo hidrofobinėje šerdyje turi didelę ertmę, kuri suteikia unikalų pagrindą mažų molekulių reguliavimui. Čia mes nustatome dirbtini

Chiralinė cikloducija

Chiralinė cikloducija

Dalykai Reakcijos mechanizmai Cheminė sintezė Angelas. Chem. Vid. Ed. 51 , 1248–1251 (2012) „Domino“ reakcijos suteikia lengvą prieigą prie sudėtingų molekulinių architektūrų, dažnai turinčių puikią stereocheminę kontrolę. Shi ir kt . pateikite elegantišką tokio požiūrio pavyzdį naujoje [2 + 2 + 2] ciklodukcijos reakcijoje, apjungiančioje Michaelio ir Henry reakcijas, kad būtų prieinamas cikloheksano produktas su stereochemiškai apibrėžtais pakaitais prie kiekvieno žiedo anglies. Visų pirma, autoriai α-ketoeste

Inteins po įvyniojimais

Inteins po įvyniojimais

Dalykai DNR pažeidimas ir taisymas Fermentų mechanizmai Modifikacijos po vertimo Baltymų struktūros prognozės Nukleorūgštys Res. doi: 10.1093 / nar / gkv612 Inteinai yra savarankiškai besisukantys elementai, kurie išskiria baltymus iš perkeltų baltymų, kad paliktų egzistento baltymus. Manoma, kad didžioji dalis funkciškai reikšmingų liekanų yra vidiniai intein, nors įrodyta, kad keli ekstino sekos, tiesiogiai besiribojančios su intein, liekanos, veikiančios funkciją. Yra žinoma, kad kai

Minimali informacija apie biosintetinių genų klasterį

Minimali informacija apie biosintetinių genų klasterį

Dalykai Biosintezė Natūralūs produktai Eilės komentaras Sintetinė biologija Yra žinoma, kad biosintetinių genų klasteriuose yra užkoduota daugybė fermentų, gaminančių specifinius metabolitus bakterijose, grybuose ir augaluose. Informacija apie šias grupes, būdus ir metabolitus šiuo metu yra išsklaidyta visoje literatūroje, todėl sunku ją naudoti. Norėdami palengvin

Peptidų sutelkimas imunitetui

Peptidų sutelkimas imunitetui

Dalykai Imunologija Peptidai Pagerinti imuninę sistemą ligoms gydyti padės geriau suprasti peptidų kilmę ir vaidmenį imunitete. Jau daugiau nei 30 metų žinoma, kad peptidai yra kritiniai veiksniai mobilizuojant imuninę sistemą nuo svetimų įsibrovėlių. Nuo to laiko naujos žinios apie peptidų generavimą ir funkcionavimą imunologijoje palaikė pastangas panaudoti imuninę sistemą ligoms gydyti. Vis dėlto dauguma l

Erratum: Aminoglikozidų aktyvumas stebimas atskiruose ribosomų prieš translokaciją atliktuose kompleksuose

Erratum: Aminoglikozidų aktyvumas stebimas atskiruose ribosomų prieš translokaciją atliktuose kompleksuose

Dalykai Veiksmo mechanizmas Ribosoma Struktūrinė biologija tRNR Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2009 m. Lapkričio 29 d Nat. Chem. Biol. 6 , 54–62 (2010); paskelbta internete 2009 m. lapkričio 29 d. pataisyta po spausdinimo 2010 m. vasario 12 d Iš pradžių paskelbtoje šio straipsnio versijoje, esančioje 6a paveiksle, dviejų inhibitorių koncentracijų vienetai buvo neteisingai pažymėti kaip „M“, kur jie turėjo būti skaitomi „μM“. Klaida buvo ištaisyta HTM

Erratum: įžvalgos apie I mukopolisacharidozę iš α-L -iduronidazės struktūros ir veikimo

Erratum: įžvalgos apie I mukopolisacharidozę iš α-L -iduronidazės struktūros ir veikimo

Dalykai Cheminė biologija Metaboliniai sutrikimai Struktūrinė biologija Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2013 m. Rugsėjo 11 d Nat. Chem. Biol. ; doi: 10.1038 / nchembio.1357; pataisyta internetu 2013 m. rugsėjo 20 d Šio straipsnio, iš pradžių paskelbto internete, metodų skyriuje „Sintetiniai IDUA inhibitoriai“ versijoje buvo du skirtingi 5F-IdoAF cheminiai pavadinimai, o visas 2F-IdoAF pavadinimas buvo netyčia praleistas. Be to, 5 pave

Klaidų ištaisymas: vandenilio peroksido, gaminamo ląstelių signalizavimui, molekulinis vaizdas

Klaidų ištaisymas: vandenilio peroksido, gaminamo ląstelių signalizavimui, molekulinis vaizdas

Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2007 m. Balandžio 1 d „Nature Chemical Biology 3“ , 263–267 (2007); paskelbta internete 2007 m. balandžio 1 d. pataisyta po spausdinimo 2007 m. gegužės 3 d Iš pradžių išleistoje šio straipsnio versijoje neteisingai parašyta antrojo autoriaus pavardė. Autoriaus varda

Klaidų taisymas: Mažos molekulės pagrįstas grįžtamasis ląstelių gyvenimo trukmės perprogramavimas

Klaidų taisymas: Mažos molekulės pagrįstas grįžtamasis ląstelių gyvenimo trukmės perprogramavimas

„Nature Chemical Biology 2“ , 369–374 (2006); paskelbta internete 2006 m. birželio 11 d. pataisyta po spausdinimo 2006 m. gruodžio 22 d Iš pradžių paskelbtoje šio straipsnio versijoje nebuvo deklaruojami jokie konkuruojantys finansiniai interesai. Dabar autoriai pareiškia, kad jie turi konkuruojančių interesų, kurie, kaip manoma, daro įtaką rezultatams ir diskusijoms, nurodytoms šiame dokumente, kurie išsamiai aprašomi konkuruojančių finansinių interesų deklaracijoje, pridedamoje prie straipsnio. Klaida buvo ištaisyta H

Ištaisymas: SMN2 sujungimo moduliatoriai sustiprina U1 prieš-mRNR ryšį ir išgelbėja SMA peles

Ištaisymas: SMN2 sujungimo moduliatoriai sustiprina U1 prieš-mRNR ryšį ir išgelbėja SMA peles

Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2015 m. Birželio 1 d Nat. Chem. Biol. 11 , 511–517 (2015); paskelbta internete 2015 m. birželio 1 d. pataisyta internete 2015 m. liepos 15 d Autoriai pamiršo į internetinius metodus įtraukti SMN baltymų lygio matavimo audinių mėginiuose aprašymą. Šis aprašymas buvo įtrauktas į HTML ir PDF straipsnio versijas. Autoriai Ieško

Bendradarbiavimo fiksavimas

Bendradarbiavimo fiksavimas

Atsižvelgiant į bendrus apibrėžimus ir bendradarbiavimo elgesio mechanizmus, galima susidaryti naujų žinių apie cheminę ir biologinę funkcijas. Bendradarbiavimas yra gerai žinomas kaip energetinis įvairių mikroskopinių įvykių, tokių kaip tuo pačiu metu vykstantis metalų jonų chelavimas, laikinas baltymų lankstymo koordinavimas ir suderinta biomolekulinių mazgų funkcija, pagrindas. Makroskopu reikia, k

Netikėta RNR

Netikėta RNR

Dvi 2006 m. Nobelio premijos atspindi RNR svarbą genų reguliavime ir pabrėžia atradimų sąveiką chemijoje ir biologijoje. RNR puikiai matėsi pastarųjų revoliucinių atradimų serijoje. 2006 m. Gruodžio mėn. Nobelio komitetas pripažino du tokius pasiekimus skirdamas Nobelio chemijos premiją Rogeriui Kornbergui už jo darbą išaiškinti RNR transkripcijos molekulinius mechanizmus ir Nobelio fiziologijos ar medicinos premiją Craigui Mello ir Andrew Fire už jų atradimą. RNR trukdžių (RNR). Mi

Ištaisymas: Dinamika sujungia substrato atpažinimą su baltymo kinazės A katalize

Ištaisymas: Dinamika sujungia substrato atpažinimą su baltymo kinazės A katalize

Dalykai Fermentų mechanizmai Kinazės Molekulinė konformacija Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2010 m. Spalio 3 d Nat. Chem. Biol. 6 , 821–828 (2010); paskelbta internete 2010 m. spalio 3 d .; pataisyta po atspausdinimo 2011 m. balandžio 18 d Iš pradžių publikuotoje šio straipsnio versijoje autoriai neteisingai pripažino finansavimą iš JAV nacionalinių sveikatos institutų, GM64742. Teisingas dot

Įtikinami komentarai

Įtikinami komentarai

Dalykai Cheminė biologija Leidyba Mokslininkai turi būti atidūs, kad užtikrintų paskelbto įrašo vientisumą ir rastų naujų būdų, kaip palengvinti mokslines diskusijas elektronikos amžiuje. Šiuolaikinių pranešimų ir socialinių tinklų epochoje naujai paskelbti moksliniai atradimai, ypač tie, kurie rodomi aukšto lygio žurnaluose, pasiekia didesnę mokslo auditoriją ir plačiąją visuomenę. Tačiau šios internetinės ž

Erratum: Endoplazminis retikulumas Ca2 + padidina mutantų gliukocerebrosidazės proteostazę

Erratum: Endoplazminis retikulumas Ca2 + padidina mutantų gliukocerebrosidazės proteostazę

Dalykai Kalcio signalizacija Endoplazminis Tinklelis Metabolinės ligos Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2010 m. Gegužės 9 d Nat. Chem. Biol. 6 , 424–432 (2010); paskelbta internete 2010 m. gegužės 9 d. pataisyta po spausdinimo 2010 m. gegužės 21 d. Iš pradžių paskelbtoje šio straipsnio versijoje vienai iš panaudotų ląstelių linijų buvo klaidingai suteiktas mutanto žymėjimas L444P pagal 6a paveikslą, o kitoje ląstelių linijoje šis žymėjimas nebuvo nurodytas atsižvelgiant į papildomą 11 a, b paveikslą. Pagrindinio teksto klaidos b

Plačiai atmerktos akys

Plačiai atmerktos akys

Norint suprasti, kaip baltymai veikia atskirai ir natūraliame kontekste, reikia sujungti molekulinio lygio metodus, tiriančius baltymų struktūros ir dinamikos sąveiką. Sąvokos „vienas genas, vienas fermentas“ ir „struktūra lemia funkciją“ yra pagrindiniai šiuolaikinės biochemijos principai. Prie to pridėkite

Pataisa: Kova su degeneracine liga naudojant cheminius zondus ir modelines sistemas

Pataisa: Kova su degeneracine liga naudojant cheminius zondus ir modelines sistemas

Dalykai Biologiniai modeliai Cheminė biologija Neurodegeneracinės ligos Terapija Nat. Chem. Biol. 10 , 911–920 (2014); paskelbta internete 2014 m. spalio 17 d .; pataisyta po spausdinimo 2014 m. gruodžio 11 d Iš pradžių paskelbtoje šio dokumento versijoje 1 lentelės PBT2 fazės įrašas netyčia buvo pažymėtas kaip „Nutrauktas“. Dabar jis buvo pat

Siaurinti tikruosius taikinius

Siaurinti tikruosius taikinius

Dalykai Cheminė genetika Proteomika Tikslo identifikavimas Daugelis kinazės inhibitorių, gydant vėžį, yra gana neselektyvūs, o jų ląsteliniai veikimo mechanizmai yra nevisiškai suprantami. Įdėta įdėta cheminės proteomikos ir cheminės genetikos strategija atskleidžia, kurie klinikinės kinazės inhibitoriaus dasatinibo ląstelių taikiniai funkciškai susiję su jo antikogeniniu aktyvumu. Reguliuojamas signali

Duomenų įdėjimas į darbą

Duomenų įdėjimas į darbą

Dalykai Duomenų bazės Genomika Mokslo bendruomenė Norint optimaliai išnaudoti postgenomo epochoje sugeneruotus išsamius duomenų rinkinius, reikės aiškių standartų ir įsipareigojimo atvirai komunikuoti. Chemikai ir biologai tradiciškai tobulino mokslą apibrėždami tam tikrą dominančią sistemą, suformuodami sistemos veikimo modelius ir išbandydami šiuos modelius didėjančios molekulinės skyros lygmenimis. Atsiradus naujoms tech

Esmė

Esmė

Didesnė parama finansavimui ir aktyvesnis cheminių biologų įsitraukimas į finansavimo procesą yra būtini šios srities pažangai. Geriausiais laikais akademiniai mokslininkai susiduria su iššūkiais, gaudami finansavimą savo nepriklausomų tyrimų pastangoms paremti. Tai nėra geriausias laikas. Pastarojo meto

Kas yra apžvalgoje?

Kas yra apžvalgoje?

Dalykai Cheminė biologija Tarpusavio apžvalga Moksliniai referentai priima kritinį vaidmenį tarpusavio vertinimo procese. Ko mes tikimės iš „ Gamtos cheminės biologijos“ apžvalgininkų? Tarpusavio peržiūra išlieka pagrindiniu aukštų standartų išlaikymo ir mokslinių tyrimų išsamumo ir tikslumo užtikrinimo mechanizmu. Tai taip pat teikia pr

Atrask save

Atrask save

Dalykai Leidyba Užtikrinimas, kad jūsų tyrimų rezultatai ir interesai būtų prieinami internete, praplečia jūsų mokslinio darbo galimybes. Mokslinė publikacija tapo mokslinio tyrimo sinonimu, suteikdama mechanizmą dalintis atradimais ir hipotezėmis bei įkvėpti būsimoms pastangoms. Tačiau vis didėjanti mokslinės literatūros apimtis riboja naujų rezultatų „surandamumą“. Be to, bendradarbiavimo

Errata: nenutrūkstama aminoacil-tRNR sintetazių evoliucija

Errata: nenutrūkstama aminoacil-tRNR sintetazių evoliucija

Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2017 m. Spalio 16 d Nat. Chem. Biol. 13 , 1253–1260 (2017); paskelbta internete 2017 m. spalio 16 d. pataisyta po spausdinimo 2017 m. gruodžio 1 d Iš pradžių publikuotoje šio straipsnio versijoje buvo perkeltos p- NF ir p -IF etikečių spalvos, esančios 4c paveiksle. Žalsvai

Ištaisymas: Arginino ramnosilinimas kaip nauja strategija aktyvuoti vertimo pailgėjimo faktorių P

Ištaisymas: Arginino ramnosilinimas kaip nauja strategija aktyvuoti vertimo pailgėjimo faktorių P

Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2015 m. Vasario 16 d Nat. Chem. Biol. ; doi: 10.1038 / nchembio.1751; pataisyta internetu 2015 m. vasario 24 d Šio straipsnio versijoje, iš pradžių paskelbtoje internete, netyčia buvo praleistas vidurinis antrojo autoriaus įrašas. Klaida buvo ištaisyta spausdinant, PDF ir HTML versijose. Autori

Pataisymas: Allosteriniai peptidai suriša kaspazės zymogeną ir tarpina kaspazės tetramerizaciją

Pataisymas: Allosteriniai peptidai suriša kaspazės zymogeną ir tarpina kaspazės tetramerizaciją

Dalykai Narkotikų patikra Fermentų mechanizmai Neurodegeneracinės ligos Struktūrinė biologija Originalus straipsnis buvo paskelbtas 2012 m. Birželio 10 d Nat. Chem. Biol. 8 , 655–660 (2012); paskelbta internete 2012 m. birželio 10 d. pataisyta po spausdinimo 2013 m. gegužės 21 d Iš pradžių paskelbtoje šio straipsnio versijoje Irina Krylova buvo netyčia pripažinta, o ne įtraukta į autorių sąrašą. Autorių sąrašas, auto