Arid1a ekspresijos praradimas prognozuoja prastą skrandžio vėžio išgyvenimo prognozę: sisteminė metaanalizė iš 14 tyrimų | mokslinės ataskaitos

Arid1a ekspresijos praradimas prognozuoja prastą skrandžio vėžio išgyvenimo prognozę: sisteminė metaanalizė iš 14 tyrimų | mokslinės ataskaitos

Anonim

Dalykai

  • Skrandžio vėžys
  • Prognostiniai žymekliai

Anotacija

Chromatino atstatymo genas, aktyvus AT 1A interaktyvus domenas ( ARID1A ), dažnai mutavo neaktyviai esant skrandžio vėžiui (GC). Tačiau jos prognozinė vertė išlieka prieštaringa. Siekiant išspręsti šią problemą, buvo atlikta išsami metaanalizė. Tyrimų, paskelbtų iki 2016 m. Kovo mėn., Buvo sistemingai ieškoma. Ši metaanalizė buvo atlikta iš viso 15 kohortų iš 14 literatūrų, kuriose dalyvavo 3183 pacientai. Apibendrinti duomenys parodė, kad ARID1A ekspresijos praradimas prognozavo prastą bendrą išgyvenamumą (OS) GC (pavojaus santykis (HR) = 1, 60; 95% patikimumo intervalas (PI) = 1, 40–1, 81; P <0, 001), esant mažam šių tyrimų heterogeniškumui ( I2 = 21, 5%; P = 0, 214). Stratifikacijos analizės parodė, kad ARID1A ekspresijos praradimas buvo susijęs su prasta OS azijiečių organizme (HR = 1, 65, 95% PI = 1, 44–1, 89), proksimalinės ligos dalis ≤ 30% pogrupio (HR = 1, 80, 95% PI = 1, 36–2, 38) ir Epšteino - Barro virusas (EBV) (+)> 5% pogrupis (HR = 1, 59, 95% PI = 1, 18–2, 15). Tvirtus rezultatus pasiūlė atlikus jautrumo analizę, o reikšmingų publikacijų šališkumo įrodymų nenustatyta. Šis tyrimas parodė reikšmingą ryšį tarp ARID1A ekspresijos ištrynimo ir prastos OS GC. Be to, etninė priklausomybė, naviko vieta ir EBV infekcijos būklė gali būti pagrindiniai veiksniai, įtakojantys šią koreliaciją.

Įvadas

Nors sergamumas pastaraisiais metais labai sumažėjo, skrandžio vėžys (GC) išlieka trečia pagal dažnumą su vėžiu susijusios mirties priežastis pasaulyje 1 . Apskaičiuota, kad 2013 m. Nuo GC mirė apie 841 000 naujų atvejų, iš kurių 77% atvejų buvo besivystančiose šalyse 2 . Nepaisant didelės pažangos ankstyvojo aptikimo ir visapusiško vėžio gydymo metodų srityje, bendras GC pacientų išgyvenamumas per penkerius metus vis dar yra mažesnis nei 25% 3 . Todėl labai svarbu nustatyti blogus GK prognostinius rodiklius ir nukreipti gydymą pacientams, turintiems negalavimų. Daugybė tyrimų parodė, kad kai kurie klinikiniai parametrai, tokie kaip TNM stadija, histologinis laipsnis, naviko žymenys serume ir terapinis būdas, yra GC 4, 5, 6, 7 prognostiniai veiksniai. Tačiau biologinio naviko elgesio negali tinkamai atspindėti aukščiau išvardyti klinikiniai parametrai. Taigi vyksta išsamūs naujų prognozinių biomarkerių tyrimai.

ATA turtingas interaktyvus domeno 1A genas ( ARID1A ), koduojantis didelį branduolinį baltymą BAF250a, yra vienas iš gyvybiškai svarbių komponentų komutatoriaus / sacharozės nefermentuojančio (SWI / SNF) chromatino rekonstravimo komplekse 8, kuris dalyvauja keliose branduolinėse veiklose, įskaitant transkripciją, DNR sintezę. ir DNR pažeidimų taisymas 9, 10, 11 . Aprašyta, kad didžioji dauguma ARID1A mutacijų, susijusių su plačiu vėžio spektru, praranda ARID1A raišką 12, 13, 14, 15, 16, o tai rodo, kad ARID1A gali elgtis kaip naviko slopintuvas 12, 17 . Be to, funkciniai tyrimai pateikia įrodymų, kad ARID1A dalyvauja keliuose kanoninio naviko slopinimo procesuose, tokiuose kaip proliferacija ir apoptozė 12 .

Neseniai naujos kartos sekoskopijos (NGS) tyrimai atskleidė, kad ARID1A mutacijų dažnis pacientams, sergantiems AKS , svyravo nuo 8% iki 27% 18, 19, 20 . Tuo tarpu didėjantis susidomėjimas buvo sutelktas į tai, ar ARID1A neveiklumas susijęs su prognozėmis pacientams, sergantiems AKS . 2011 m. Wang ir kt . pranešė, kad ARID1A mutacija buvo nepriklausomai susijusi su geresniu GC 18 rezultatu. Vėliau „Ibarrola-Villava M.“ ir kt . pranešė panašūs rezultatai 21 . Kiti tyrėjai teigė, kad ARID1A ekspresijos praradimas buvo reikšmingai susijęs su trumpesniu išgyvenimu 22, 23 arba neturėjo prognostinio poveikio GC 24 . Todėl ARD1A trūkumo prognostinis vaidmuo pacientams, sergantiems GC, išlieka ginčytinas.

Iki šiol buvo pranešta apie sistemingą metaanalizę, tiriančią ARID1A raiškos praradimo prognostinį vaidmenį sergant vėžiu, įskaitant virškinimo trakto vėžį, 25, tačiau metaanalizėje analizuotų literatūros straipsnių kalba apsiribojo anglų kalba. Kadangi pusė visų GC atvejų yra Rytų Azijoje (daugiausia Kinijoje), o GC sergamumas Azijoje yra daug didesnis nei kitose srityse 1, vertinga įtraukti kinų kalbos straipsnius į metaanalizę, atsižvelgiant į GC. Šiame tyrime siekėme gauti geresnį supratimą apie ARID1A raiškos praradimo prognostinę reikšmę pacientams, sergantiems GC, atlikdami metaanalizę, naudodamiesi literatūros straipsniais, paskelbtais tiek anglų, tiek kinų kalbomis (iš Kinijos nacionalinės žinių infrastruktūros (CNKI) ir Wanfang duomenų bazės). ).

Rezultatai

Tinkamų studijų savybės

1 paveiksle pavaizduota išsami tyrimo rinkimų procedūra. Iš pradžių pagal raktinių žodžių paiešką buvo identifikuoti 44 potencialiai svarbūs leidiniai anglų kalba ir 16 leidinių kinų kalba. Iš jų 26 nepriklausomus recenzentus 26 straipsnius išskyrė per pavadinimo ir abstraktų atranką, o 20 straipsnių buvo pašalinta per išsamų straipsnių patikrinimą. Galiausiai 14 publikacijų atitiko kriterijus ir buvo įtrauktos į šią metaanalizę.

Image

Visas dydis

14 straipsnių (15 grupių) charakteristikos apibendrintos 1 lentelėje. Iš viso nuo 2012 m. Iki 2016 m. Kovo mėn. Buvo atlikti keturiolika tyrimų, kuriuose dalyvavo 3183 pacientai. Tarp jų du tyrimai (319 atvejų) atlikti ne azijiečių, 21, 26, šeši tyrimai (892 atvejai) kinų kalba 22, 23, 27, 28, 29, 30, keturi tyrimai (1233 atvejai) korėjiečių kalba 24, 31, 32, 33 ir du tyrimai (739 atvejai) japonų kalba 34, 35 . Informacija apie mikrosatelitų nestabilumą (MSI) buvo surinkta aštuoniuose tyrimuose (devyniose grupėse). Tarp jų buvo pranešta apie MSI būklę šešioms kohortoms pagal neatitikimo korekcijos baltymų imunohistocheminę analizę ir dviem kohortoms - pagal polimerazės grandininę reakciją (PGR) ir DNR elektroforezę. Vienoje kohortoje 31, naudojant abu metodus, MSI procentas buvo nurodytas atitinkamai 12, 7% pagal IHC metodą ir 8, 2% pagal DNR elektroforezę (1 lentelė). Kadangi DNR metodo elektroforezę rekomendavo Nacionalinis vėžio institutas (NCI), mes savo tyrime priėmėme 8, 2% ir šią grupę suskirstėme į MSI ≤ 10% pogrupį.

Pilno dydžio lentelė

Imunohistochemija (IHC) buvo vienintelis metodas, naudojamas aptikti ARID1A raišką. ARID1A trūkumo ribinės vertės buvo apibrėžtos kaip silpnos vėžio ląstelės arba be jų branduolio dažymas arba branduolinis dažymas <10%. Visuose 14 tyrimų, kurių imčių dydis buvo nuo 66 iki 489, buvo pranešta apie OS, tačiau tik dviejuose tyrimuose buvo pranešta apie išgyvenamumą be ligos (DFS), o viename tyrime buvo pranešta apie išgyvenamumą be ligos progresavimo (PFS). Taigi šio tyrimo pasekmė buvo tik OS.

Meta-analizė

Visų tyrimų metaanalizių rezultatai parodyti 2 pav. ARID1A ekspresijos praradimas reikšmingai susijęs su prasta OS (HR = 1, 60; 95% PI = 1, 40–1, 81; P <0, 001) pacientams, sergantiems GC (2 pav.). .2). Šių tyrimų (2 lentelė) heterogeniškumo testas parodė mažą heterogeniškumą ( I 2 = 21, 5%; P = 0, 214), o tai rodo gerą nuoseklumą, o 14 tyrimų rezultatus galima sujungti.

Image

HR, pavojaus santykis; CI, pasitikėjimo intervalas.

Visas dydis

Pilno dydžio lentelė

Stratifikuota analizė

Pogrupių analizės buvo suskirstytos pagal etninę kilmę, ligos vietą, Epšteino-Baro viruso (EBV) infekcijos procentą, TNM stadiją, naviko diferenciaciją, MSI būklę, ARID1A trūkumo procentą ir imties dydį.

Kaip išvardyta 2 lentelėje, prognozuojamas ARID1A ekspresijos praradimo vaidmuo azijiečiams (HR = 1, 65, 95% PI = 1, 44–1, 89, P <0, 001), pogrupio viršutinėje skrandžio trečiojoje dalyje ≤30% (HR = 1, 65). 1, 80, 95% PI = 1, 36–2, 38, P 5% (HR = 1, 59, 95% PI = 1, 18–2, 15, P = 0, 002). Priešingai, ARID1A ekspresijos praradimas reikšmingai nesusijęs su prasta LŠ sergančių pacientų baigtimi ne -Azijos (HR = 1, 50; 95% PI = 0, 53–4, 20, P = 0, 444) arba didelė proksimalinio skrandžio dalis (viršutinė trečioji skrandžio dalis> 30%, HR = 1, 20, 95% PI = 0, 40–3, 61, P = 0, 750) pogrupis arba EBV (+) ≤ 5% pogrupis (HR = 2, 20, 95% PI = 0, 93–5, 22, P = 0, 073). Atrodė, kad etninė priklausomybė, ligos vieta ir EBV infekcijos būklė gali turėti įtakos ARID1A praradimo ir prasta OS, tačiau mes nustatėme, kad ARID1A ekspresijos sumažėjimas koreliavo su prasta OS GC, neatsižvelgiant į naviko klinikinę stadiją, naviko diferenciaciją, MSI būklę, ARID1A trūkumo laipsnį ir imties dydį (2 lentelė).

Jautrumo analizė ir publikacijų šališkumas

Jautrumo analizė buvo atlikta paeiliui pašalinant kiekvieną tyrimą iš jungtinės analizės, siekiant įvertinti metaanalizės rezultatų tvirtumą. Kaip parodyta 3 lentelėje, vieno tyrimo praleidimas statistiškai nepakeitė surinktų HR rezultatų, tai rodo, kad mūsų metaanalizės rezultatai buvo akivaizdžiai stabilūs ir patikimi.

Pilno dydžio lentelė

Vertinant publikacijos šališkumą buvo naudojamas Begg piltuvo brėžinys ir Egger testas. Vizualiai apžiūrint, Begg piltuvo forma atrodė simetriška (3 pav.). Nei Begg'io testas ( P = 0, 235), nei Eggerio testas ( P = 0, 146) nenustatė jokių publikacijos šališkumo įrodymų.

Image

Visas dydis

Diskusija

Kiek mums yra žinoma, tai yra išsamiausia metaanalizė, tirianti ARID1A praradimo prognostinį vaidmenį sergantiems AK. Mūsų tyrimas atskleidė, kad ARID1A ekspresijos praradimas buvo blogos prognozės rodiklis GC pacientams. Įvertinta, kad bendras mirties pavojus ARID1A raiškos praradimo grupėje padidėjo 60%, palyginti su ARID1A raiškos grupe. Heterogeniškumo bandymų, jautrumo analizės ir publikacijų šališkumo rezultatai patvirtino mūsų išvadų patikimumą. Koreliacija tarp ARID1A ekspresijos praradimo ir prastos OS išliko pogrupių analizėse, neatsižvelgiant į naviko klinikinę stadiją, ARID1A ekspresijos nepakankamumo laipsnį, mėginio dydį, naviko diferenciaciją ir MSI būklę. Be to, kai stratifikacija buvo analizuojama pagal tautybę, ligos vietą ir EBV būklę, ARID1A ekspresijos praradimas galėjo numatyti prastą AK sergančiųjų azijiečių OS, proksimalinės ligos proporciją ≤30% ir EBV (+)> 5% pogrupyje, bet ne tarp - Azijos, arba proksimalinės ligos dalis> 30% arba EBV (+) ≤ 5% pogrupio.

2015 m. - metaanalizė, kurią paskelbė Luchilin ir kt . ištyrė ARID1A mutacijos būklės prognostinį vaidmenį sergant daugeliu vėžio rūšių ir parodė, kad ARID1A ekspresijos praradimas nėra susijęs su visų priežasčių sukeltu mirštamumu virškinimo trakto vėžiu 25, o tai neatitinka mūsų išvadų. Konflikto išvados reikalauja išsamesnio tyrimo. Tačiau mes tikime, kad mūsų tyrimas davė tvirtesnių įrodymų, nes mūsų rezultatai buvo gauti iš daugiau kinų literatūros, daugiau GC pacientų iš Rytų Azijos ir didesnio GC pacientų skaičiaus (3183 palyginti su 1176 pacientais tyrime, kurį atliko Luchilin ir kt .). Be to, nevienalytiškumo testo, jautrumo analizės ir publikacijų šališkumo testo rezultatai parodė, kad mūsų išvados yra stabilios.

Kadangi Huang ir kt . pateikė įrodymų, kad ARID1A atsirado kaip naviko slopiklis 2007 m. 36, palaipsniui buvo paviešinti molekuliniai mechanizmai, lemiantys blogesnį rezultatą vėžiu sergantiems pacientams, sergantiems ARID1A ekspresijos trūkumu 14, 17 . Manoma, kad ARID1A prisideda prie naviko slopinimo trim pagrindiniais aspektais. Pirma, kaip vartininkas, ARID1A geba sureguliuoti ląstelių proliferaciją nukreipdamas ląstelių ciklą arba skatindamas apoptozę. Tyrimas in vitro parodė, kad ARID1A ekspresijos nutildymas padidino GC ląstelių proliferaciją ir kolonijų susidarymą, o ARID1A ekspresijos atkūrimas davė atvirkštinį efektą 19 . Tolesnis funkcinis tyrimas parodė, kad ARID1A, bendradarbiaudamas su p53, reguliavo kelis pasroviui taikomus genus, tokius kaip CDKN1A (p21) ir SMAD3 , kad sulaikytų ląstelių ciklą 17 . Antra, ARID1A gali veikti kaip „prižiūrėtojas“, užkertant kelią genomo nestabilumui. Naujausi duomenys parodė, kad ARID1A vaidino gyvybiškai svarbų vaidmenį reguliuojant DNR pažeidimo patikrinimo vietą ir vėliau padidinantį DNR pažeidimo signalizavimą37. Paskutinis, vis gausėjantis įrodymų skaičius rodo, kad kai kurių genų ar kelių aktyvinimas gali veikti kartu su ARID1A praradimu ir pagreitinti vėžio vystymąsi. Pavyzdžiui, buvo nustatyta, kad PI3K / Akt kelio ir TP53 būklės pokyčiai yra koreliuojami su ARID1A ekspresijos praradimu, kai yra aiški kiaušidžių karcinoma, endometriumo vėžys ir GC 18, 19, 38, 39 .

GC naviko stadija ir naviko diferenciacija buvo esminiai klinikiniai prognostiniai žymenys 5, 40 . Kadangi prognozuojamas MSI vaidmuo, atsirandantis dėl DNR neatitikimo taisymo sistemų inaktyvavimo 41, GC 42 išlieka neaiškus. Buvo pranešta, kad ARID1A ekspresijos praradimas reikšmingai koreliavo su naviko stadija 22, 31, diferenciacijos laipsnio 32 ir MSI būkle 22, 32 esant GC. Pavyzdžiui, Wang atskleidė, kad ARID1A ekspresijos praradimas buvo reikšmingai susijęs su T stadija ir diferenciacijos 22 laipsniu. Kim ir kt . nustatė, kad visiškai ARID1A ekspresijos praradimas buvo 57, 7% silpnai diferencijuotos skrandžio adenokarcinomos atveju, daug daugiau nei vidutiniškai diferencijuoto GC (25%) ir gerai diferencijuoto GC (7, 7%) 32 atveju . Wang ir Han atitinkamai pranešė apie ARID1A geną, kuris dažnai mutavo esant MSI aukštam GC 18, 31 . Tačiau neaišku, ar šie veiksniai tarpininkauja ryšiui tarp ARID1A ekspresijos praradimo ir prastos OS. Mūsų pogrupio analizė atskleidė, kad ARID1A trūkumo prognostinis vaidmuo GC nepriklauso nuo naviko stadijos (T ir N), diferenciacijos laipsnio ir MSI būklės. Be to, nei ARID1A ekspresijos nepakankamumas, nei imties dydis neturėjo įtakos ryšiui tarp ARID1A ekspresijos praradimo ir prognozės GC. Šie rezultatai parodė, kad ARID1A ekspresijos praradimas buvo stiprus ir stabilus GC biomarkeris.

Pabrėžtina, kad pagal pogrupių analizę pagal tautybes paaiškėjo, kad ARID1A ekspresijos praradimas turėjo reikšmingą neigiamą poveikį AK sergantiems azijiečiams, bet ne azijiečiams. Taip pat šis ryšys tarp ARID1A praradimo ir blogesnės OS galėjo būti nustatytas proporcingai proksimalinės ligos ≤ 30% pogrupio daliai, bet ne didelėje proksimalinės ligos pogrupio proporcijoje. Atrodė, kad etninė priklausomybė ir ligos vieta gali būti potencialūs kritiniai veiksniai, turintys įtakos ryšiui tarp ARID1A praradimo ir blogos GK prognozės. Naviko vieta labai skiriasi priklausomai nuo etninės priklausomybės ir geografinės teritorijos. Pavyzdžiui, ne proksimalinis GC vyrauja Japonijoje ir Korėjoje, o proksimalinis GC dažniau būna vakarų šalyse 43, 44 . Tokie naviko lokalizacijos pokyčiai kartu su genetine fone gali lemti naviko elgesio ir rezultato skirtumus 45, 46, o tai gali užtemdyti ARID1A ekspresijos praradimo reikšmę prognozėje.

Su EBV susijusi skrandžio karcinoma (EBVaGC), dažnai diagnozuojama ne skrandžio antrinėje dalyje, dažniau pasitaiko Vakarų šalyse 47, 48, 49 . Nors kai kurie tyrimai parodė, kad EBVaGC 31, 34 dažnai trūksta ARID1A nuostolių, ARID1A nuostolių prognostinis vaidmuo EBVaGC išlieka neįrodytas 50, 51 . Mūsų tyrimas parodė, kad prasta prognostinė ARID1A reikšmė GC egzistavo EBV (+)> 5% pogrupyje, o tai nesutapo su išvadomis, kad ARID1A ekspresijos praradimas galėjo numatyti prastą OS Azijoje ir proksimalinės ligos proporciją ≤30% pogrupyje. Pažymėtina, kad atskirų asmenų duomenys apie EBV infekcijos būklę buvo menki, todėl koreliacijos tarp EBV infekcijos būklės, naviko lokalizacijos ir etninės priklausomybės mūsų tyrime nebuvo išsamiau nagrinėjamos.

Kaip literatūros pagrindu atlikta metaanalizė, būtina atkreipti dėmesį į mūsų tyrimo apribojimus. Visų pirma, visi įtraukti tyrimai buvo gauti iš retrospektyvių duomenų, galinčių sukelti atrankos paklaidą. Taigi būsimi tyrimai yra būtini norint patvirtinti mūsų atradimą ateityje. Antra, tik du tyrimai, kuriuos sudarė 3 grupės ir sudarė tik 10% visų atvejų, buvo ne Azijos gyventojų. Taigi, ne azijiečių išvada buvo mažiau įtikinanti. Ateityje būtina atlikti daugiau originalių tyrimų su ne Azijos AK sergančiais pacientais. Trečia, iš išgyvenimo kreivių buvo išgauta keletas HR, dėl kurių gali atsirasti nedidelių klaidų. Tačiau mūsų jautrumo analizė reikšmingai nepakeitė rezultatų, o tai leido manyti, kad tokių klaidų poveikis buvo ribotas. Galiausiai šie įtraukti tyrimai nepateikė informacijos apie chemoterapiją ar radioterapiją, todėl mūsų tyrimas nebuvo ištirtas, ar chemoterapija ir radioterapija gali įtakoti ryšį tarp ARID1A ekspresijos sumažėjimo ir išgyvenamumo GC.

Nepaisant aukščiau išvardytų apribojimų, tai yra išsamiausia iki šiol atlikta metaanalizė, skirta kiekybiškai įvertinti ARID1A raiškos praradimo prognostinę reikšmę GC sergantiems pacientams. Mūsų rezultatai rodo, kad ARID1A neveiklumas yra reikšmingai susijęs su prasta GK sergančių pacientų OS, kuri gali būti naudojama norint nustatyti blogo rezultato pacientus ir nukreipti klinikinio gydymo moduliavimą. Visų pirma, mūsų pogrupių analizė taip pat rodo, kad etninė priklausomybė ir naviko vieta gali būti pagrindiniai šio ryšio veiksniai, nors kai kurių pogrupių imtys yra palyginti nedidelės. Ateityje reikia patvirtinti didesnio masto perspektyvinius tyrimus, kurie patvirtintų ARID1A ekspresijos praradimą kaip prognozuojamą vaidmenį LPS sergantiems pacientams. Be to, kadangi daugialypiai žymekliai gali pateikti tikslesnę prognozinę informaciją nei vienas rodiklis, tyrimai, vertinantys ARID1A ekspresijos praradimą derinant su kitais prognozės žymekliais, yra būtini norint įvertinti jų vertę GC išgyvenamumui.

Metodai

Leidinių paieškos strategijos

Atlikta literatūros paieška naudojant straipsnius „Pubmed“, „Embase“, „Web of Science“, „Cochrane“ biblioteką, Kinijos nacionalinę žinių infrastruktūrą (CNKI) ir „Wanfang“ duomenų bazę. Paskutinė paieška buvo atnaujinta 2016 m. Kovo 3 d. Paieškos strategijoje buvo šie terminai su įvairiais deriniais: GC („skrandžio karcinoma“ arba „skrandžio neoplazma“ arba „GC“ arba „skrandžio vėžys“ arba „skrandžio navikas“), ARID1A („ARID1A“ arba „BAF250a“) ir prognozė („prognozė“, „prognozė“ arba „baigtis“). Gautų leidinių informaciniai sąrašai toliau buvo rankiniu būdu peržiūrimi, kad būtų galima nustatyti galimus straipsnius.

Studijų įtraukimo ir pašalinimo kriterijai

Į šią metaanalizę įtraukti tyrimai turėjo atitikti visus šiuos kriterijus: (1) pacientai, pasamdyti su histologiškai įrodytu GC; (2) ištyrė ryšį tarp ARID1A trūkumo ir prognozės; (3) ARID1A trūkumas buvo patikrintas pirminio skrandžio naviko audinyje imunohistochemija (IHC), egzomo sekos nustatymu arba atvirkštinės transkripcijos polimerazės grandinine reakcija; (4) buvo pranešta apie pavojingumo laipsnį (HR) ir jo 95% pasikliovimo intervalą (CI) arba jį buvo galima apskaičiuoti. Jei egzemplioriai buvo dubliuoti ar duomenys nesutampa, buvo pateiktas naujausias ar išsamesnis straipsnis. Pagal įtraukimo kriterijus du recenzentai (LY ir HHX) tinkamumo vertinimą atliko nepriklausomai, o dviejų recenzentų nesutarimai buvo išspręsti bendru sutarimu.

Duomenų gavimas

Iš įtrauktų tyrimų buvo gauta ši informacija: pirmasis autorius, publikavimo metai, kilmės šalis, imties dydis, klinikinė stadija, vietos diferenciacijos laipsnis, ARID1A raiškos tyrimas (metodai, ribinis lygis ir dažnis) bei išgyvenamumo duomenys. Jei buvo pranešta apie tiek kintamąjį, tiek daugiamatį HR ir jų 95% PI, buvo naudojami daugiamatis HR.

Pavojaus santykio pašalinimas

Šiame tyrime metaanalizei atlikti buvo naudojami HR ir jų 95% PI. Kai jie buvo duoti literatūroje, mes juos gaudavome tiesiogiai. Kai jie nebuvo tiesiogiai aprašyti, mes juos išskyrėme iš turimų skaitmeninių duomenų arba paskelbėme išgyvenimo kreives, naudodamiesi metodais, aprašytais „Parmar 52“ ir „Tierney 53“ .

Statistinė analizė

Stebimas meta-HR> 1 reiškė blogesnę ARID1A trūkumo grupės prognozę, jei jos 95% PI nepersidengė 1 ( P <0, 05). Įtrauktų tyrimų heterogeniškumas buvo įvertintas naudojant Cochran Q- testą ir I 2 testą. Jei P ≤ 0, 10 Cochran Q bandyme arba I 2 reikšmė ≥ 50% I 2 bandyme, heterogeniškumas buvo laikomas statistiškai reikšmingu. Jei reikšmingo nevienalytiškumo nėra, buvo naudojami fiksuoto efekto modeliai. Kitu atveju buvo atlikti atsitiktinių efektų modeliai. Buvo atlikti pogrupių analizės pagal tautybę, klinikinę stadiją, diferenciacijos laipsnį, MSI ir pan., Siekiant ištirti veiksnius, kurie gali turėti įtakos ARID1A trūkumo poveikiui prognozei. Siekiant ištirti surinktų rezultatų stabilumą, buvo atlikta jautrumo analizė. Norėdami įvertinti publikacijos paklaidą, buvo naudojamas piltuvo brėžinys su Beggo ir Eggerio testu, o P > 0, 05 buvo įvertinta, ar nėra publikacijos paklaidų. Visos statistinės analizės buvo atliktos naudojant STATA statistinę programinę įrangą, versija 12.0 („Stata Corporation“, College Station, TX).

Papildoma informacija

Kaip pacituoti šį straipsnį : Yang, L. et al . ARID1A ekspresijos praradimas prognozuoja blogą skrandžio vėžio išgyvenimo prognozę: sisteminė metaanalizė iš 14 tyrimų. Mokslas. Rep. 6, 28919; „doi“: 10.1038 / srep28919 (2016).

Komentarai

Pateikdami komentarą jūs sutinkate laikytis mūsų taisyklių ir bendruomenės gairių. Jei pastebite ką nors įžeidžiančio ar neatitinkančio mūsų taisyklių ar gairių, pažymėkite, kad tai netinkama.